財務・会計システムに使える補助金一覧
会計ソフト、経費精算、電子帳票の導入
会計や経理の業務は、制度対応が投資のきっかけになりやすい領域です。インボイス制度や電子帳簿保存法への対応は、やらなければならない対応であると同時に、紙とハンコで回していた処理を見直す機会でもあります。製造業の場合、会計単体で導入するより、生産管理や購買のデータと繋いで原価を把握できるようにするほうが投資効果が出ます。補助金の事業計画でも、単なる制度対応より業務改善として書いたほうが評価されやすくなります。
投資の対象になるもの
- 会計システム
- 仕訳の自動化と月次決算の早期化
- インボイス・電子帳簿対応
- 適格請求書の発行・保存要件への対応
- 経費精算
- 紙の申請書と手入力をなくす
- 原価計算
- 製品別・工程別の原価を把握する
- 債権債務管理
- 入金消込と支払管理の自動化
どの制度を選ぶか
IT導入補助金にはインボイス対応や電子帳簿保存に向けた枠が設けられることがあり、会計ソフトの導入では第一候補になります。補助上限は設備投資系の制度より小さいものの、対象が明確で申請しやすい領域です。自治体の小規模事業者向けデジタル化支援も、会計・労務のシステム導入を対象にしていることが多くあります。
申請前の注意点
補助金そのものの会計処理にも注意が必要です。補助金は原則として収益に計上され課税対象になるため、圧縮記帳などの扱いを顧問税理士と事前に確認しておいてください。
財務・会計システムに使える補助金
26件の補助金が見つかりました（受付終了分は除いています）
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（19次締切）
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（19次締切）（最大4000万円）。ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金は、中小企業・小規模事業者等が今後複数年にわたり相次いで直面する制度変更（働き方改革や被用者保険の適用拡大、賃上げ、インボイス導入等）等に対応するため、中小企業・小規模事業者等が取り組む革新的サービス開発・試作品開発・生産プロセスの改善を行うための設備投資等を支援するものです。
令和8年度神奈川県小規模事業者デジタル化支援推進事業費補助金
令和8年度神奈川県小規模事業者デジタル化支援推進事業費補助金（最大50万円）。人手不足が深刻化する小規模事業者が実施するデジタル技術の活用により業務効率化を図る事業に要する経費に対し補助することで、持続的な県経済の発展を目指します。
令和8年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業
令和8年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業（補助額要確認）。医療機関が新たに電子カルテシステムを導入するために必要なコンサルタントの活用等に係る費用を補助することで、電子カルテシステムの導入を支援し、医療情報の共有、連携を促進することを目的とする。
令和８年度東京都医療ＤＸ人材育成支援事業
令和８年度東京都医療ＤＸ人材育成支援事業（最大50万円）。医療機関の職員のＩＴ・ＤＸに関する資格取得に係る経費等を支援することで、電子カルテの操作等、医療ＤＸに関連する知識・技能等を有する人材の育成を図り、もって電子カルテシステムを始めとするデジタル技術の導入を支援することを目的とします。
【山形県】令和8年度やまがた未来くるエネルギー補助金（山形県再生可能エネルギー等設備導入促進事業）
製造業の中小企業が活用できる補助金です。【山形県】令和8年度やまがた未来くるエネルギー補助金（山形県再生可能エネルギー等設備導入促進事業）（補助額要確認）。詳細は申請ページをご確認ください。
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（20次締切）
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（20次締切）（最大3500万円）。ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金は、中小企業・小規模事業者等が今後複数年にわたり相次いで直面する制度変更（働き方改革や被用者保険の適用拡大、賃上げ、インボイス導入等）等に対応するため、中小企業・小規模事業者等が取り組む革新的サービス開発・試作品開発・生産プロセスの改善を行うための設備投資等を支援するものです。
岡崎ものづくり支援補助金（共同研究事業）
岡崎ものづくり支援補助金（共同研究事業）（最大50万円）。岡崎市内のものづくり事業所が新製品・新技術の開発、既存製品の高付加価値化のため、大学又は試験研究機関等との共同研究に取り組む費用の一部を補助します。対象となる経費は、大学又は試験研究機関へ支払う研究費および相談料です（振込手数料は除く）。
岡崎ものづくり支援補助金（依頼試験事業）
岡崎ものづくり支援補助金（依頼試験事業）（最大50万円）。岡崎市内のものづくり事業所が新製品・新技術の開発、既存製品の高付加価値化を目的に行う、大学又は試験研究機関等での依頼試験の費用の一部を補助します。対象となる経費は、大学又は試験研究機関へ支払う試験費、相談料です（振込手数料は除く）。
岡崎ものづくり支援補助金（知的財産権取得事業）
岡崎ものづくり支援補助金（知的財産権取得事業）（最大30万円）。岡崎市内のものづくり事業所が、新製品・新技術の開発や既存製品・技術の高付加価値化等の事業活動のため、日本国特許庁に「特許出願（PCT出願を含む）」および「特許出願審査請求」を行う費用の一部を補助します。
岡崎ものづくり支援補助金（プラットフォーム活用事業）
岡崎ものづくり支援補助金（プラットフォーム活用事業）（最大50万円）。岡崎市内のものづくり事業所が、新製品・新技術の開発や既存製品・技術の高付加価値化のために、他の事業者とのマッチングを支援・提案するサービス（プラットフォーム）を利用する費用の一部を補助します。対象となる経費は、サービスを利用するにあたり、かかる登録費用、運営機能費用、伴走支援費用です（振込手数料は除く）。
岡崎ものづくり支援補助金（新製品共創事業）
岡崎ものづくり支援補助金（新製品共創事業）（最大30万円）。岡崎市内のものづくり事業所が、新製品・新技術の開発、既存製品の高付加価値化のため、市内外の事業者と共同で新製品などの試作品を開発する事業に係る費用の一部を補助します。対象となる経費は、新製品を開発するにあたってかかった試作品の原材料費用です（送料、振込手数料は除く）。
【大阪府和泉市】再エネ・省エネ機器設置促進事業補助金（事業者用）
【大阪府和泉市】再エネ・省エネ機器設置促進事業補助金（事業者用）（補助額要確認）。本市における脱炭素化を推進することを目的として、太陽光発電設備や蓄電池等を新たに設置する者に対し、予算の範囲内において、補助金を交付します。
小樽市省エネルギー診断補助金
製造業の中小企業が活用できる補助金です。小樽市省エネルギー診断補助金（最大5万円）。詳細は申請ページをご確認ください。
令和8年度 農林水産物認証取得支援事業（森林認証取得支援事業）補助金
令和8年度 農林水産物認証取得支援事業（森林認証取得支援事業）補助金（最大40万円）。公益財団法人東京都農林水産振興財団では、持続可能性に配慮した森林管理等を推進するため、森林認証取得に要する経費を補助します。【認証の種類】・ＳＧＥＣ (Sustainable Green Ecosystem Council)：緑の循環認証会議・ＦＳＣ (Forest Stewardship Council)：森林管理協議会・ＰＥＦＣ(Programme fo…
令和８年度スキルアップ支援事業
令和８年度スキルアップ支援事業（最大250万円）。☆令和８年度分についてはこちらからご申請ください。令和７年度の実績報告は、マイページより行ってください。都内の中小企業等が従業員に対して行う研修の経費の一部を助成します。研修の内容や実施方法に応じた助成金を活用しましょう！
【長野県茅野市】製造業等労務環境改善・競争力強化促進補助金
【長野県茅野市】製造業等労務環境改善・競争力強化促進補助金（補助額要確認）。市内製造業等の中小企業者における経済社会情勢の変化、またはDX（デジタルトランスフォーメーション）およびGX（グリーントランスフォーメーション）に対応した労務環境改善と競争力強化の取組を促進するための補助金です。地域の強みである製造業の付加価値の向上や、デジタル技術関連の産業集積を図るため、設備投資等に要する経費に対して交付します。
橿原市業務改善支援補助金
製造業の中小企業が活用できる補助金です。橿原市業務改善支援補助金（最大10万円）。詳細は申請ページをご確認ください。
【長野県茅野市】受注及び販路開拓支援事業補助金
【長野県茅野市】受注及び販路開拓支援事業補助金（補助額要確認）。市内中小企業者等の技術や製品のPR・受注を促すため、受注開拓や販路開拓を目的とした展示会・見本市等への出展経費に対し、予算の範囲内で補助金を交付する制度です。
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（21次締切）
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（21次締切）（最大4000万円）。ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金は、中小企業・小規模事業者等が今後複数年にわたり相次いで直面する制度変更（働き方改革や被用者保険の適用拡大、賃上げ、インボイス導入等）等に対応するため、中小企業・小規模事業者等が取り組む革新的サービス開発・試作品開発・生産プロセスの改善を行うための設備投資等を支援するものです。
【長野県茅野市】中小企業人材育成等支援補助金
【長野県茅野市】中小企業人材育成等支援補助金（補助額要確認）。茅野市の商工業の振興を図るため、中小企業者等が技術力及び経営力の強化を目的として行う人材育成、経営改善事業等に要する経費の一部を補助します。情報サービス業を行う方や、DX(デジタルトランスフォーメーション)・GX(グリーントランスフォーメーション)関連の研修会・講座を受講または開催される場合は、補助率が引き上げられます。
【埼玉県】令和7年度埼玉県民間事業者CO₂排出削減設備導入補助金（緊急対策枠）
【埼玉県】令和7年度埼玉県民間事業者CO₂排出削減設備導入補助金（緊急対策枠）（最大500万円）。本事業は、国の「物価高騰対応重点支援地方創生臨時交付金」を活用した事業です。中小企業等におけるエネルギー使用量及びCO₂排出量の削減による体質改善を更に促すため、空調設備・ボイラー等の高効率タイプへの更新や蓄電池と組み合わせた太陽光発電設備などの導入に要する経費の一部を補助します。
岡崎ものづくり支援補助金（見本市等出展事業）
岡崎ものづくり支援補助金（見本市等出展事業）（最大30万円）。岡崎市内のものづくり事業所が、見本市等に出展して販路開拓に取り組む費用の一部を補助します。対象となる経費は、見本市等出展料、見本市等の主催者に対して申し込む会場設営費です（振込手数料は除く）。
【愛知県大府市】2026年度大府市カーボンニュートラル推進生産設備導入支援補助金（ユーティリティ設備）
【愛知県大府市】2026年度大府市カーボンニュートラル推進生産設備導入支援補助金（ユーティリティ設備）（最大100万円）。市内で製造業を営む中小企業者の設備更新による光熱費等削減及び生産性の向上による競争力強化を実現するとともに、事業者の脱炭素経営を支援するため、エネルギー消費効率の高い設備への更新費用を補助します。
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（22次締切）
【経済産業省】ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金（22次締切）（補助額要確認）。ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金は、中小企業・小規模事業者等が今後複数年にわたり相次いで直面する制度変更（働き方改革や被用者保険の適用拡大、賃上げ、インボイス導入等）等に対応するため、中小企業・小規模事業者等が取り組む革新的サービス開発・試作品開発・生産プロセスの改善を行うための設備投資等を支援するものです。
令和8年度診療所診療情報デジタル推進事業
令和8年度診療所診療情報デジタル推進事業（補助額要確認）。電子カルテシステムの医科診療所への導入を支援することにより、地域における診療情報の共有、連携を促進することを目的とする。
中小企業省力化投資補助金（一般型）
人手不足解消のため、IoT・ロボット等デジタル技術を活用した専用設備（オーダーメイド設備）の導入を支援します。 生産性向上や付加価値額向上、賃上げに繋がる省力化投資を促進します。 例：生産工程の自動化、業務プロセスの効率化、サービス提供方法のデジタル化。